Logo Radboudumc

Vacatures geplaatst door Radboudumc

Mimir verzorgt het geautomatiseerde beheer van vacatures op vacaturebanken voor Radboudumc.

Laatste vacatures

PhD candidate ‘Innate immune reprogramming in obesity’

We are looking for two PhD students to work together with our research team on the role of inflammation and the innate immune system in the development of atherosclerosis in subjects with obesity. In a cohort study in 300 subjects with obesity omics-based data (genomics, metabolomics) are integrated with detailed phenotyping of the innate immune system and in a subgroup bone marrow progenitors. This approach has been developed within The Human Functional Genomics Projects (HFGP) of which the present study is part of. In addition, several in vivo intervention studies have been planned, as well as in vitro studies on innate immune memory.

Tasks and responsibilities

  • Analyze samples of cohorts: circulating markers and cytokine production after ex vivo stimulation PBMCs;
  • For the clinical PhD student: plan and execute small proof-of-concept intervention studies in subjects with obesity;
  • Plan and perform scientific in vitro experiments in an independent manner;
  • Critically analyze data;
  • Take a leading role in writing manuscripts;
  • Present data at local, national and international scientific meetings;
  • Supervise MSc and/or BSc students;
  • Write and defend a PhD thesis within four years of starting the project;
  • Candidate will take part in the graduate school of Radboudumc.

AcademicTransfer

0 sollicitaties
0 views


26-03-2019 Radboudumc
Postdoc ‘Innate immune reprogramming in obesity’

We are looking for a talented postdoctoral researcher to work together with our research team on the role of inflammation and the innate immune system in the development of atherosclerosis in subjects with obesity. In a cohort study in 300 subjects with obesity omics-based data (genomics, metabolomics) are integrated with detailed phenotyping of the innate immune system and in a subgroup bone marrow progenitors. This approach has been developed within The Human Functional Genomics Projects (HFGP) of which the present study is part of. In addition, several in vivo intervention studies have been planned, as well as in vitro studies on innate immune memory.

Taken en verantwoordelijkheden

  • Analyze samples of cohorts: circulating markers and cytokine production after ex vivo stimulation PBMCs; assessment of transcriptomics, epigenomics, metabolomics;
  • Plan and perform scientific in vitro experiments in an independent manner;
  • Critically analyze data;
  • Co-supervision of PhD students;
  • Take a leading role in writing manuscripts;
  • Present data at local, national and international scientific meetings;
  • Supervise MSc and/or BSc students.

AcademicTransfer

0 sollicitaties
0 views


26-03-2019 Radboudumc
Data Steward for Rare Diseases Project

As the number of rare disease patients is small by definition, there is a pressing need for the joint analysis of patient data on natural disease history, genetic makeup, disease modifiers and treatment outcomes. However, the available data is fragmented across different care providers, registries, and countries, and cannot be used to their full potential because data get lost, are not associated with descriptive metadata, or miss essential details on the way they are produced. We took important first steps in the development of interoperable patient registries, based on the FAIR principles, facilitating joint analysis of patient data from multiple registrie.

We are now looking for an enthusiastic and ambitious data steward, who will support clinicians to increase the FAIRness of their patient data, and unlock them for use in clinical patient management, research and improvement in quality of care. The data steward will develop data models and tools to capture FAIR data at the source (i.e. where the data are generated or analysed) and facilitate the publication of research data in FAIR Data Points and registries. A specific focus will be on the joint analysis of data from clinical registries and patient reported outcomes. The data steward will work in the context of the European Joint Programme on Rare Diseases and closely interact with data stewards appointed on other projects (X-omics, FAIRgenomes) with highly similar goals.

Tasks and responsibilities

  • Design (meta)data models for rare disease data based on existing ontologies and standards;
  • Engaging with clinicians, and support and train them in FAIR data management and the data FAIRification process, e.g. through participation in Bring-Your-Own-Data workshops;
  • Co-develop software, tooling, services, and Standard Operating Procedures (SOP) / policy around the FAIR capture and publication of data and metadata;
  • Participation in national and international data stewardship discussion groups and coordination and competence building initiatives, such as the rare disease linked data and ontology task force and the data steward interest group run by the Dutch Techcentre for the Life Sciences;
  • Work with the RTC-DS team to optimize the DRE for FAIR data stewardship.

AcademicTransfer

0 sollicitaties
0 views


26-03-2019 Radboudumc
Data Scientist / Postdoctoral research on Rare Diseases

Within the context of the European Joint Programme on Rare Diseases (EJPRD, coordinated by Dr. Julkowska, Inserm, Paris), we are looking for an ambitious data scientist, who develops data analysis and integration approaches for multi-omics (genome, transcriptome, proteome, metabolome) data from rare disease patients. The candidate will closely work with clinical researchers from several European Reference Networks (ERNs) and develop improved diagnostic routines, approaches for detecting genetic and environmental modifiers of disease, and drug repurposing strategies. The candidate is committed to the counselling and training of biomedical and clinical researchers in computational approaches. The candidate will contribute to the realization of a digital research environment (DRE) where these computational approaches can be applied and which contributes to the Findability, Accessibility, Interoperability and Reusability (FAIRness) of data, tools and services.

Tasks and responsibilities

  • Develop and benchmark computational approaches for the analysis of multi-omics data;
  • Lead scientist in the analysis of relevant multi-omics data sets from rare disease patients;
  • Advise and support biomedical scientists and clinicians in multi-omics analyses and FAIR data management;
  • Co-develop software, tooling, services, and Standard Operating Procedures (SOP) / policy around the FAIR capture, analysis and publication of data and metadata;
  • Participation in national and international meetings and communities such as the European Joint Programme on Rare Diseases, RD-Connect, Europe's bioinformatics infrastructure ELIXIR, the Dutch X-omics infrastructure.

AcademicTransfer

0 sollicitaties
0 views


26-03-2019 Radboudumc
Arts onderzoeker / promovendus IBD

Wil jij naast promoveren de kans krijgen om de kwaliteit van zorg voor patiënten met inflammatoire darmziekten (IBD) naar een hoger plan te tillen? Wij zoeken een kandidaat voor een promotietraject binnen de IBD.

Wij bieden jou als basisarts met interesse in maag-, darm- en leverziekten (MDL) een unieke mogelijkheid om te promoveren binnen een afdeling die hard op weg is om toonaangevend te zijn. Wij willen onze stempel drukken op onderzoek om zo de zorg voor onze patiënt te verbeteren. Niet voor niets investeren we doorlopend in nieuwe behandelmethoden en in baanbrekend onderzoek. Maar ook de manier waarop we iedere dag bezig zijn met de beste persoonsgerichte zorg aan het bed maakt ons bijzonder. Ons motto is 'Samen béter!'. En jij kunt hieraan in een patiëntgebonden onderzoekstraject van 3 jaar een wezenlijk steentje bijdragen. Inhoudelijk en als persoon.

Als onderzoeksarts verdiep je jezelf onder begeleiding van dr. Frank Hoentjen, dr. Willemijn van Dop en prof. Joost Drenth in een van de vele boeiende aspecten van maag-, darm- en leverziekten. Daarbij is jouw en ons primaire doel een academische promotie. We verwachten van jou dat je een groot project in meerdere ziekenhuizen in het land weet te managen en met jouw enthousiasme en goede communicatieve vaardigheden het project verder op de kaart zet in binnen- en buitenland.

Projectomschrijving
Je promotietraject zal tot doel hebben om de kwaliteit van zorg voor patiënten met IBD te verbeteren. Er zijn meerdere projecten die op korte termijn zullen starten, waarin jouw bijdrage essentieel zal zijn. Zo loopt er momenteel in het Radboudumc een project dat kijkt naar de mogelijkheid voor IBD-patiënten die in remissie zijn om meer controles in de thuissituatie te kunnen doen en zo minder vaak naar het ziekenhuis te hoeven. Op deze manier hebben zijn meer regie over de behandeling van hun ziekte, wat leidt tot een bevordering van patiënttevredenheid en doelmatigheid van zorg. Officiële data volgen nog, maar dit project lijkt nu al enorm succesvol te zijn en om deze reden willen we het graag uitrollen over de regio. Dit betekent nauwe samenwerking met de omliggende ziekenhuizen, waar jouw communicatieve vaardigheden goed van pas zullen komen.

Daarnaast willen we graag regionale zorgpaden opzetten met betrekking tot extra-intestinale manifestaties bij IBD, zoals gewrichtsklachten en dermatologische manifestaties. Door het opzetten van een grote database zal het mogelijk zijn om uitkomsten van screening en gestandaardiseerde behandeling bij te houden, en zo meer inzicht te krijgen in de variabelen die onset en beloop van exra-intestinale manifestaties bij IBD voorspellen. Ook voor dit project zal nauwe samenwerking met omliggende ziekenhuizen, alsmede andere disciplines zoals de reumatologie en dermatologie vereist zijn.

Taken PhD

  • Regionaal implementeren van een project voor IBD-patiënten om meer regie te krijgen over hun eigen ziekte;
  • Helpen opzetten en implementeren van regionale zorgpaden met betrekking tot extra-intestinale manifestaties bij IBD;
  • Coördineren van de dataverzamelingen en uitvoeren van de data-analyse conform het onderzoeksplan;
  • Schrijven van wetenschappelijke publicaties voor internationale tijdschriften en beursaanvragen.

Twitter

0 sollicitaties
0 views
Bekijk vacature


25-03-2019 Radboudumc